Frem til føllet er ca et halvt år gammelt har det med seg antistoffer fra moren i blodet. Når føllet er et halvt år gammelt, bør det grunnvaksineres.

Hester bør vaksineres mot hesteinfluensa og stivkrampe. I tillegg velger noen å vaksinere avlshopper mot ekvint herpesvirus.

Grunnvaksinering
Dette består av to vaksineringer med mellom 4 og 6 ukers mellomrom. Deretter må hesten vaksineres hvert år for å ha tilfredsstillende beskyttelse.

Revaksinering
Dette gjøres årlig. Drektige hopper bør vaksineres, gjerne mellom halvveis i drektigheten og ca. en måned før forventet følling.

Sykdommene det vaksineres mot:

• Hesteinfluensa: Luftveisinfeksjon forårsaket av virus. Det er meget smittsomt, og det er derfor obligatorisk med vaksinering før stevner og løp.
• Herpesinfeksjon: Kan gi samme symptomer som influensaviruset og i tillegg føre til at hopper aborterer i siste del av drektigheten.
• Stivkrampe: Forårsaket av bakterier som kan finnes i jorda. Hvis hesten får en skade, for eksempel stikker seg på en spiker, kan bakteriene slå seg ned inne i såret og produsere en gift. Denne giften fører til kramper for dyret, gjerne etter flere uker. Stivkrampe fører vanligvis til at hesten dør. Hvis en uvaksinert hest får et alvorlig sår, bør den vaksineres i løpet av de første dagene.